本所碩士班成立於1997年，為全球第一個致力於臺灣語言與語文教育之研究所，並於2003年成立博士班。所內師資與課程規劃涵括臺灣語言、語言研究和語言教學等層面，強調研究與教學兼具的實務取向，目的是培養「臺灣語言」、「語言研究」和「語言教學」等相關領域的專業人才。
一、課程方面：
（一）碩士班課程：
本所碩士班課程架構主要以語言學通論(一)(二)為基礎必修課程，佐以論文寫作與研究方法訓練，從而依各自性向，選擇臺灣語言、語言研究或語言教學領域開發相關專長。選修課程共有50門，可以分為「特色課程」、「語言教學」和「語言研究」。
「特色課程」包含「臺灣語言綜論、臺灣語言計量專題研究、臺灣南島語專題研究、臺灣南島語句法研究、南灣南島語構詞研究、臺灣客家語專題研究、臺灣閩南語專題研究、閩客語法專題研究、閩客詞彙專題研究…」等15門。以「語言教學」為主軸的是「語言習得、原住民族語教學、客家語語言教學、閩南語語言教學、雙語教學研究、語文領域數位學習教材研發與評鑑、閱讀理論與閱讀教學、寫作教學研究…」等19門。強化各「語言研究」領域的訓練課程共有「生理語音學、語言田野調查、語言接觸專題研究、社會語言學專題研究、語言與大腦、語用學、認知語言學、語法與詞彙語意介面專題、歷史語言學…」等16門。
（二）博士班課程：
博士班課程的規劃目標是培養學生獨立自主的研究能力，能統整描述語言或教學狀況，並提出自己獨到具體的理論分析。由於博士生已經具備一定研究基礎，鑽研領域各有不同，所以課程一律皆為選修；學生可以依研究興趣選擇「特色課程」、「語言與教學」、「語言分析」以及「教學研究」等不同領域，以方法為導向或語言為導向貫穿各領域的學習研究。
二、發展特色
本所除了致力於博士班和碩士班辦學外，持續發展臺灣語言語料庫、臺灣語文教育資料庫、臺灣語言及其教育學術研究等；所內定期舉辦相關學術會議，加強國內外各級學術單位的聯繫與合作交流。多元族群是臺灣的現象，也是本所的學習特色，所上學生來自各個南島語言族群與閩客語族群。我們一方面希望能培養各個語言族群的研究教學人才，傳承臺灣語言與語文教育特色，另一方面則是從跨族群的學習生活中，學會珍視自身族群的語言文化資產，並進而尊重他族文化。